花蓮年平均溫約為攝氏23.5度,較臺灣西部高出約0.5度,且夏季長達八個月,降雨豐沛,因此一般人對花蓮的印象是炎熱、潮濕。實際上,花蓮因為全區地域狹長,南北長度約為兩百多公里,北迴歸線從瑞穗通過,所以氣候上可以瑞穗作分界,以北為亞熱帶氣候,以南則為熱帶氣候;另外因高山林立,來自赤道的太平洋黑潮屬暖流,具有調節氣候的功用,因此可再依地理位置的不同,區分為高地氣候與季風氣候,秀姑巒溪兩岸的雨林區則因高降水量,為臺灣少有的熱帶雨林氣候。
颱風的侵擾也是花蓮氣候的特色之一。每年七八月為臺灣颱風的旺季,因颱風大都形成於菲律賓外海,東部尤為首當其衝,因此花蓮常在夏季受到狂風暴雨侵襲,而西部因為有中央山脈的屏障,相較之下影響較小。
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