臺南聯外交通十分方便,主要營運的客運業者包括國光客運、統聯客運、和欣客運、高雄客運等。
提供幾乎臺灣全部路線的服務。臺南總站位於臺南公園路對面的兵配廠停車場,是所有國道客運臺南總站的下車地點,而這裡也是距臺南車站最近的下車地點。若要到臺南車站,可以在兵配廠下車地點的公園路上搭公車前往,由於距車站只有一站的距離,一律半票9圓,最好自備零錢。提供的路線包括臺北、桃園、新竹、嘉義、臺南、高雄等地。
提供前往全臺灣,北自臺北,南至高雄的大部份路線,包含臺南、臺灣桃園國際機場等。統聯客運臺南總站位於臺南市北區北門路二段71號,走路至臺南火車站約5分鐘路程。
提供西部各主要縣市往來路線,包含臺北、桃園、臺中、彰化、嘉義、臺南、高雄等。和欣客運臺南總站位於臺南市北門路二段25號,走路至臺南火車站約5分鐘路程。
提供高雄至臺南、屏東路線服務。高雄客運臺南站位於臺南市北區公園南路152巷30弄46號(兵配廠內)。